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Grupo de Virología Molecular

El grupo dirigido por el Prof. Titular Dr. Rodney Colina está ubicado en la sede Salto.

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Dr. Matías Castells

Asistente
(Gdo 2, 40 hs/sem)

  

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Dr. Andrés Lizasoain

Ayudante
(Gdo 1, 30 hs/sem)

  

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MSc. Viviana Bortagaray

Estudiante de doctorado PEDECIBA

 

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Ing. Elec. Marcos Grilli

Ingeniero en electrónica
(R12, 40 hs/sem)

 

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Líneas de investigación

  • Estudio del Virus del Papiloma Humano y virus entéricos (Norovirus, Astrovirus y Rotavirus).

  • Estudio de anticuerpos neutralizantes de SARS-CoV-2 de pacientes que cursaron COVID-19 así como de personas vacunadas, mediante la utilización del "Ensayo de Neutralización por reducción de Placas (PRNT)".

  • Aislamiento y titulación por Ensayo de Placas de nuevos linajes y variantes de SARS-CoV-2 que son utilizadas como virus de referencia en los ensayos de PRNT, como las VOC Delta, Gamma, Omicron. Estos estudios son realizados utilizando un Laboratorio de Bioseguridad Nivel 3.

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  • Virus que afectan la reproducción en Bovinos como el Virus de la Diarrea viral bovina (BVDV), y Herpes virus bovino (BoHV).

  • Epidemiología y evolución de enterovirus humanos.

  • Virología Ambiental.

  • Virosis emergentes con impacto en la salud humana.

  • Estudio de la variabilidad genética y evolución del virus de la Hepatitis C en Uruguay.

  • Caracterización molecular y evolutiva de viruses de ganado bovino que impactan en la producción de carne y leche en Uruguay.

  • Caracterización de viruses relacionados al Síndrome de Diarrea Neonatal (DNT) en terneros.

  • Estudio de la dispersión ambiental de viruses con impacto en la salud animal en establecimientos ganaderos de Uruguay.

  • Viral Discovery mediante herramientas de metagenómica a partir de muestras ambientales y clínicas asociadas al ganado bovino.

  • Evolución de virus emergentes con impacto en salud humana, animal y vegetal.

  • Detección de virus gastroentéricos en aguas ambientales.

Últimas publicaciones

SALUD HUMANA

 

2023

SARS-CoV-2 intra-host diversity, antibody response, and disease severity after reinfection by the variant of concern Gamma in Brazil. Naveca FG, Nascimento VA, Nascimento F, Ogrzewalska M, Pauvolid-Corrêa A, Araújo MF, Arantes I, Batista ÉR, Magalhães AÁ, Vinhal F, Mattos TP, Riediger I, Debur MDC, Grinsztejn B, Veloso VG, Brasil P, Rodrigues RR, Rovaris DB, Fernandes SB, Fernandes C, Santos JHA, Abdalla LF, Costa-Filho R, Silva M, Souza V, Costa ÁA, Mejía M, Brandão MJ, Gonçalves LF, Silva GA, de Jesus MS, Pessoa K, Corado ALG, Duarte DCG, Machado AB, Zukeram KA, Valente N, Lopes RS, Pereira EC, Appolinario LR, Rocha AS, Tort LFL, Sekizuka T, Itokawa K, Hashino M, Kuroda M, Dezordi FZ, Wallau GL, Delatorre E, Gräf T, Siqueira MM, Bello G, Resende PC. Sci Rep. 2023 May 5;13(1):7306. doi: 10.1038/s41598-023-33443-1. 

​

Reduced ability to neutralize the Omicron variant among adults after infection and complete vaccination with BNT162b2, ChAdOx1, or CoronaVac and heterologous boosting.

Espíndola OM, Fuller TL, de Araújo MF, Tort LFL, Guaraldo L, Calvet G, Resende P, Bonaldo M, Whitworth J, Smith C, Siqueira M, Brasil P. Sci Rep. 2023 May 8;13(1):7437. doi: 10.1038/s41598-023-34035-9. 

​

Infectious SARS-CoV-2 Particles from Rectal Swab Samples from COVID-19 Patients in Brazil.

Ribeiro IP, Nascimento LGD, Tort LFL, Pereira EC, Menezes LSR, Malta FC, Oliveira BCEPD, Rodrigues JP, Manso PPA, Pelajo M, Bonaldo MC, Silva PCR, Siqueira MM, Brasil P, Fumian TM. Viruses. 2023 May 11;15(5):1152. doi: 10.3390/v15051152. 

​

2022

GII.4 human norovirus and G8P[1] bovine-like rotavirus in oysters (Crassostrea gigas) from Argentina.

Mozgovoj M, Miño S, Barbieri ES, Tort FL, Victoria-Montero M, Frydman C, Cap M, Baron PJ, Colina R, Matthijnssens J, Parreño V. Int J Food Microbiol. 2022 Mar 16;365:109553. doi: 10.1016/j.ijfoodmicro.2022.109553.

https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35074658/

​

2021

SARS-CoV-2 variant N.9 identified in Rio de Janeiro, Brazil.

Tort LFL, Ribeiro IP, Menezes LSR, Dos Santos AAC, Santos MP, Damasceno L, Silva PCR, de Siqueira MAMT, Brasil P, Bonaldo MC. Mem Inst Oswaldo Cruz. 2021 Nov 8;116:e210166. doi: 10.1590/0074-02760210166. 

​

Evaluation of SYBR Green real time PCR for detecting SARS-CoV-2 from clinical samples.

Pereira-Gómez M, Fajardo Á, Echeverría N, López-Tort F, Perbolianachis P, Costábile A, Aldunate F, Moreno P, Moratorio G. J Virol Methods. 2021 Mar;289:114035. doi: 10.1016/j.jviromet.2020.114035. 

​

Emergence and Spread of a B.1.1.28-Derived P.6 Lineage with Q675H and Q677H Spike Mutations in Uruguay.

Rego N, Salazar C, Paz M, Costábile A, Fajardo A, Ferrés I, Perbolianachis P, Fernández-Calero T, Noya V, Machado MR, Brandes M, Arce R, Arleo M, Possi T, Reyes N, Bentancor MN, Lizasoain A, Bortagaray V, Moller A, Chappos O, Nin N, Hurtado J, Duquía M, González MB, Griffero L, Méndez M, Techera MP, Zanetti J, Pereira E, Rivera B, Maidana M, Alonso M, Smircich P, Arantes I, Mir D, Alonso C, Medina J, Albornoz H, Colina R, Bello G, Moreno P, Moratorio G, Iraola G, Spangenberg L. Viruses. 2021 Sep 10;13(9):1801. doi: 10.3390/v13091801.

https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34578382/

​

Real-Time Genomic Surveillance for SARS-CoV-2 Variants of Concern, Uruguay.

Rego N, Costábile A, Paz M, Salazar C, Perbolianachis P, Spangenberg L, Ferrés I, Arce R, Fajardo A, Arleo M, Possi T, Reyes N, Bentancor MN, Lizasoain A, Benítez MJ, Bortagaray V, Moller A, Bello G, Arantes I, Brandes M, Smircich P, Chappos O, Duquía M, González B, Griffero L, Méndez M, Techera MP, Zanetti J, Rivera B, Maidana M, Alonso M, Alonso C, Medina J, Albornoz H, Colina R, Noya V, Iraola G, Fernández-Calero T, Moratorio G, Moreno P. Emerg Infect Dis. 2021 Nov;27(11):2957-2960. doi: 10.3201/eid2711.211198. 

https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34437831/

​

Recurrent Dissemination of SARS-CoV-2 Through the Uruguayan-Brazilian Border.

Mir D, Rego N, Resende PC, Tort F, Fernández-Calero T, Noya V, Brandes M, Possi T, Arleo M, Reyes N, Victoria M, Lizasoain A, Castells M, Maya L, Salvo M, Schäffer Gregianini T, Mar da Rosa MT, Garay Martins L, Alonso C, Vega Y, Salazar C, Ferrés I, Smircich P, Sotelo Silveira J, Fort RS, Mathó C, Arantes I, Appolinario L, Mendonça AC, Benítez-Galeano MJ, Simoes C, Graña M, Motta F, Siqueira MM, Bello G, Colina R, Spangenberg L. Front Microbiol. 2021 May 28;12:653986. doi: 10.3389/fmicb.2021.653986.

https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34122369/

​

​

SALUD ANIMAL

​

2023

Development of an IgY-Based Treatment to Control Bovine Coronavirus Diarrhea in Dairy Calves.

Bok M, Vega CG, Castells M, Colina R, Wigdorovitz A, Parreño V. Viruses. 2023 Mar 9;15(3):708. doi: 10.3390/v15030708.

https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36992417/

​

​

2022

Bovine Polyomavirus-1 (Epsilonpolyomavirus bovis): An Emerging Fetal Pathogen of Cattle That Causes Renal Lesions Resembling Polyomavirus-Associated Nephropathy of Humans.

Giannitti F, da Silva Silveira C, Bullock H, Berón M, Fernández-Ciganda S, Benítez-Galeano MJ, Rodríguez-Osorio N, Silva-Flannery L, Perdomo Y, Cabrera A, Puentes R, Colina R, Ritter JM, Castells M. Viruses. 2022 Sep 14;14(9):2042. doi: 10.3390/v14092042.

https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36146848/

 

Determination of an RT-qPCR viral load cutoff point for the etiologic diagnosis of rotavirus A diarrhea in neonate dairy calves.

Caffarena RD, Castells M, Schild CO, Casaux ML, Armendano JI, Colina R, Giannitti F. Front Vet Sci. 2022 Aug 12;9:952197. doi: 10.3389/fvets.2022.952197.

https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36032290/

 

[Neurotropic bovine astrovirus-associated encephalitis: An underdiagnosed disease in South America?].

Doncel Díaz B, Castells M, Maya L, Fraga M, Uzal FA, Colina R, Giannitti F. Rev Argent Microbiol. 2022 Apr-Jun;54(2):100-105. doi: 10.1016/j.ram.2021.01.006.

https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34148730/

 

Evolutionary history and spatiotemporal dynamic of GIII norovirus: From emergence to classification in four genotypes.

Castells M, Cristina J, Colina R. Transbound Emerg Dis. 2022 Jul;69(4):1872-1879. doi: 10.1111/tbed.14168.

https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34038622/

 

Diagnostic Investigation of 100 Cases of Abortion in Sheep in Uruguay: 2015-2021.

Dorsch MA, Francia ME, Tana LR, González FC, Cabrera A, Calleros L, Sanguinetti M, Barcellos M, Zarantonelli L, Ciuffo C, Maya L, Castells M, Mirazo S, da Silva Silveira C, Rabaza A, Caffarena RD, Doncel Díaz B, Aráoz V, Matto C, Armendano JI, Salada S, Fraga M, Fierro S, Giannitti F. Front Vet Sci. 2022 May 19;9:904786. doi: 10.3389/fvets.2022.904786.

https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35664842/

 

2021

Causes of neonatal calf diarrhea and mortality in pasture-based dairy herds in Uruguay: a farm-matched case-control study.

Caffarena RD, Casaux ML, Schild CO, Fraga M, Castells M, Colina R, Maya L, Corbellini LG, Riet-Correa F, Giannitti F. Braz J Microbiol. 2021 Jun;52(2):977-988. doi: 10.1007/s42770-021-00440-3.

https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33575990/

​

 

SALUD VEGETAL

​

2023

Biological and molecular characterization of a resistance-breaking isolate of citrus tristeza virus from Uruguay and its effects on Poncirus trifoliata growth performance.

Rubio L, Arruabarrena A, Salvo M, Castells M, Bertalmío A, Hernández-Rodríguez L, Benítez-Galeano MJ, Maeso D, Colina R, Rivas F. Arch Virol. 2023 Mar 29;168(4):123. doi: 10.1007/s00705-023-05749-y.

https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36988730/

 

 

VIROLOGÍA AMBIENTAL

​

2022

High abundance of high-risk Human Papillomavirus genotypes in wastewater in Uruguay.

Victoria M, Moller A, Salvo M, Baccardatz N, Colina R. J Water Health. 2022 Dec;20(12):1748-1754. doi: 10.2166/wh.2022.330.

https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36573677/

 

One-Year Surveillance of SARS-CoV-2 and Rotavirus in Water Matrices from a Hot Spring Area.

Salvo M, Azambuya J, Baccardatz N, Moriondo A, Blanco R, Martinez M, Direnna M, Bertolini G, Gamazo P, Colina R, Alvareda E, Victoria M. Food Environ Virol. 2022 Dec;14(4):401-409. doi: 10.1007/s12560-022-09537-w.

https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36181654/

 

2021

First evidence of enterovirus A71 and echovirus 30 in Uruguay and genetic relationship with strains circulating in the South American region.

Lizasoain A, Mir D, Salvo M, Bortagaray V, Masachessi G, Farías A, Rodríguez-Osorio N, Nates S, Victoria M, Colina R. PLoS One. 2021 Aug 12;16(8):e0255846. doi: 10.1371/journal.pone.0255846. 

https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34383835/

​

Evaluation of low-cost viral concentration methods in wastewaters: Implications for SARS-CoV-2 pandemic surveillances.

Salvo M, Moller A, Alvareda E, Gamazo P, Colina R, Victoria M. J Virol Methods. 2021 Nov;297:114249. doi: 10.1016/j.jviromet.2021.114249. 

https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34339765/

 

Human Enterovirus Diversity by Next-Generation Sequencing Analysis in Urban Sewage Samples From Buenos Aires Metropolitan Area, Argentina: A Retrospective Study.

Lizasoain A, Mir D, Victoria M, Barrios ME, Blanco-Fernández MD, Rodríguez-Osorio N, Nates S, Cisterna D, Mbayed VA, Colina R. Food Environ Virol. 2021 Jun;13(2):259-269. doi: 10.1007/s12560-021-09468-y.

https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33675515/

 

Environmental Surveillance through Next-Generation Sequencing to Unveil the Diversity of Human Enteroviruses beyond the Reported Clinical Cases.

Lizasoain A, Mir D, Masachessi G, Farías A, Rodríguez-Osorio N, Victoria M, Nates S, Colina R. Viruses. 2021 Jan 17;13(1):120. doi: 10.3390/v13010120.

https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33477302/

 

Proposal of a pathway for enteric virus groups detection as indicators of faecal contamination to enhance the evaluation of microbiological quality in freshwater in Argentina.

Masachessi G, Prez VE, Michelena JF, Lizasoain A, Ferreyra LJ, Martínez LC, Giordano MO, Barril PA, Paván JV, Pisano MB, Farías AA, Isa MB, Ré VE, Colina R, Nates SV. Sci Total Environ. 2021 Mar 15;760:143400. doi: 10.1016/j.scitotenv.2020.143400. 

https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33199001/

Integrantes

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Dr. Rodney Colina

Responsable del grupo
(Gdo 5, 40 hs/sem, DT)

​

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Dr. Matías Victoria

Profesor Agregado
(Gdo 4, 40 hs/sem, DT)

 

CVUy

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Dr. Fernando López

Profesor Adjunto 
(Gdo 3, 40 hs/sem, DT)

  

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​

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Dra. Leticia Maya

Asistente
(Gdo 2, 40 hs/sem, DT)

 

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Integrantes
Lineas
Publicaciones
Colaboraciones

Colaboraciones

COLABORACIONES ACADÉMICAS CON INSTITUCIONES NACIONALES:

  • Dirección de Laboratorios Veterinarios. Ministerio de Ganadería, Agricultura y Pesca (sedes Paysandú, Treinta y Tres y Montevideo)

  • Instituto Nacional de Investigaciones Agropecuarias (Estación La Estanzuela y Estación Salto Grande)

  • Facultad de Veterinaria. Universidad de la República

  • Facultad de Ciencias. Universidad de la República

  • Facultad de Química. Universidad de la República

  • Instituto Pasteur de Montevideo

  • Instituto de Investigaciones Biológicas Clemente Estable. Ministerio de Educación y Cultura

  • Asociación Española

  • Corporación Médica de Paysandú (COMEPA)

  • Cátedra de Pediatría. Facultad de Medicina. Hospital Escuela del Litoral. Administración de Servicios de Salud del Estado

  • Direcciones Departamentales de Salud de Paysandú y Salto. Ministerio de Salud Pública

  • Gerencia de Gestión Ambiental. Obras Sanitarias del Estado

​

COLABORACIONES ACADÉMICAS CON INSTITUCIONES EXTRANJERAS:

  • Centros para el Control y Prevención de Enfermedades, CDC. Atlanta. Estados Unidos

  • Universidad de California. Estados Unidos

  • Instituto de Virología J.M. Vanella. Facultad de Ciencias Médicas. Universidad Nacional de Córdoba. Argentina

  • Cátedra de Virología. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Universidad de Buenos Aires. Argentina

  • Administración Nacional de Laboratorios e Institutos de Salud “Dr. Carlos Malbrán”. Ministerio de Salud de la Nación. Argentina

  • Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA Castelar, INTA Cerro Azul). Argentina

  • Laboratorio de Enterovirus. Instituto Oswaldo Cruz. Fundación Oswaldo Cruz. Ministerio de Salud. Brasil

  • Laboratorio de Virología Comparada y Ambiental. Instituto Oswaldo Cruz. Fundación Oswaldo Cruz. Ministerio de Salud. Brasil

  • Laboratorio de Virus Respiratorios, Exantemáticos, Enterovirus y Emergencias Virales. Instituto Oswaldo Cruz. Fundación Oswaldo Cruz. Ministerio de Salud. Brasil

Enseñanza

Enseñanza

DOCENCIA A NIVEL DE GRADO

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Ciclo Biología Bioquímica (CBB) y Ciclo Inicial Científico Tecnológico (CIO-CT). Departamento de Ciencias Biológicas. CENUR Litoral Norte.

 

Biología Celular y Molecular (2018-actualidad)

 

Curso a cargo del personal docente del Laboratorio de Virología Molecular. Dictado de clases teóricas y prácticas. Responsables del curso: Dr. Rodney Colina y Dr. Matías Victoria.

 

  • Introducción a las Ciencias Biológicas I (2011-actualidad)

Dictado de clases teóricas y moderación de grupos de discusión. Coordinación en 2014 (Dra. Leticia Maya).

 

  • Introducción a las Ciencias Biológicas II (2012-actualidad)

Dictado de clases teóricas y dictado de seminarios teórico prácticos de investigación. Coordinación desde 2019 a la fecha (Dra. Leticia Maya)

 

Participación de docentes del Laboratorio de Virología Molecular como invitados en otros cursos de grado:

 

  • Bioquímica. Carrera: Ingeniero Agrónomo. Facultad de Agronomía. CENUR Litoral Norte. Universidad de la República.

  • Microbiología. Carrera: Doctor en Medicina Veterinaria. Facultad de Veterinaria. CENUR Litoral Norte. Universidad de la República.

  • Microbiología. Carrera: Licenciatura en Laboratorio Clínico. Escuela Universitaria de Tecnología Médica. Facultad de Medicina. CENUR Litoral Norte. Universidad de la República.

  • Virología Molecular. Carreras: Licenciatura en Ciencias Biológicas/Licenciatura en Bioquímica. Facultad de Ciencias. Universidad de la República.

  • Bases Biomoleculares II. Carrera: Ciclo Inicial en Salud. Facultad de Medicina. CENUR Litoral Norte. Universidad de la República.

​

DOCENCIA A NIVEL DE POSGRADO

 

Curso PEDECIBA:

 

  • Virus de Interés para la Salud Humana, Animal y Vegetal (dictado en 2016 y 2017, y desde 2018 con frecuencia cada dos años). Responsables: Dr. Matías Victoria y Dr. Rodney Colina.

 

Participación de docentes del Laboratorio de Virología Molecular como invitados en otros cursos de posgrado:

 

  • Biología Molecular de enfermedades virales. Programa de Desarrollo de las Ciencias Básicas. 2010.

  • Dinámica de las gastroenteritis de etiología viral. Posgraduación en Biología Molecular y Celular, Instituto Oswaldo Cruz, FIOCRUZ, Rio de Janeiro, Brasil. 2013.

  • Curso básico de filogenia y evolución de agentes virales. Programa de Desarrollo de las Ciencias Básicas. Cenur Litoral Norte. 2014.

  • Diarrea neonatal en terneros: abordajes diagnósticos. Programa de Desarrollo de las Ciencias Básicas. Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria, La Estanzuela (2019 – a la fecha).

  • Virus en foco: Biología viral en el contexto animal, humano y ambiental. Programa de Desarrollo de las Ciencias Básicas. Facultad de Veterinaria. 2021.

Extensión

  • Tutorías de pasantía de investigación de estudiantes de cuarto año de profesorado del CERP, especialidad Ciencias Biológicas.

  • Programa Acortando Distancias. Programa de becas para que docentes de enseñanza media realicen pasantías en centros donde se realiza investigación científica y tecnológica. Financiamiento de PEDECIBA. El laboratorio recibió alumnos durante 2014-2015.

  • Charlas a diferentes púbicos en el marco de la celebración de la Semana de la Ciencia y Tecnología.

  • Charlas y talleres en centros educativos sobre temas relacionados a virología.

  • Exposiciones en seminarios y jornadas técnicas dirigidas a público especializado en temas productivos/salud animal.

  • Evaluación de trabajos en Ferias de Clubes de Ciencia del Ministerio de Educación y Cultura y Administración Nacional de Educación Pública.

  • Participación en entrevistas y ciclos de divulgación en medios de prensa locales y nacionales sobre temas relacionados a virología.

El Dr. Rodney Colina, responsable del primer Laboratorio de Bioseguridad Nivel 3 de Uruguay, explica la importancia de que la Universidad de la República haya construido un laboratorio de estas características en el interior del país. Programa Sobre Ciencia (TV Ciudad).

El Dr. Matías Victoria comenta aspectos relevantes de la investigación de la circulación de genotipos del virus del papiloma humano relacionados a un alto riesgo de contraer cáncer. Programa Sobre Ciencia (TV Ciudad).

Los docentes del Laboratorio de Virología Molecular, Dra. Leticia Maya y Dr. Matías Castells relatan cuáles virus que afectan la reproducción del ganado bovino y ovino en nuestro país se estudian en el laboratorio con el fin de mejorar la productividad. Programa Sobre Ciencia (TV Ciudad).

El Dr. Andrés Lizasoain explica la importancia de estudiar los enterovirus en muestras ambientales y clínicas en nuestro país. Programa Sobre Ciencia (TV Ciudad).

Artículo en el Semanario La Diaria destaca la publicación de resultados de un proyecto realizado desde el Laboratorio de Virología Molecular y liderado por el Dr. Matías Victoria, en el cual se demostró que las aguas del Río Uruguay y del Río Santa Lucía presentan niveles de contaminación fecal originados a partir de aportes similares de humanos y ganado vacuno. Esta investigación es pionera en el país en utilizar un abordaje virológico para realizar Microbial Source Tracking en cursos de agua.

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El portal de noticias de Telemundo (teledoce.com) destacó la divulgación de las primeras fotografías de un SARS-CoV2 en Uruguay, las cuales fueron obtenidas mediante la utilización de un microscopio electrónico de la sede Rocha del CURE (por Álvaro Olivera) a partir de una colaboración con la investigadora Viviana Bortagaray del Laboratorio de Virología Molecular.

Extensión
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